A mí me gusta mantener los registros intactos, pero no dejo de encontrarme usuarios preguntando cómo eliminar el historial de videollamadas de Whatsapp (y las conversaciones también, claro).
Es el funcionamiento básico: entras en la sección correspondiente, visualizas los tres puntos verticales que te dan acceso a opciones extra y le dices que te elimine todo el historial. O seleccionas las llamadas concretas y le das al icono del contenedor.